هر فرآیند کسب‌ و کار تنها به‌وسیله‌ یک سازمان به اجرا درمی‌آید.
اگر تعاملی بین فرآیندهای کسب‌ و کار انجام‌شده به‌وسیله‌ دیگر سازمان‌ها وجود نداشته ‌باشد، فرآیند مورد نظر درون‌سازمانی خوانده‌می‌شود.
اما اغلب فرآیندهای کسب‌ و کار با فرآیندهای سایر سازمان‌ها  تعامل دارند و فرآیندهای بین‌سازمانی را تشکیل می‌دهند:
مانند فرآیند سفارش‌دهی کالا از یک سازمان به سازمان دیگر.
تاکید اولیه‌ فرآیندهای سازمانی کسب‌ و کار بر ساده‌سازی فرآیندهای داخلی ازطریق حذف فعالیت‌های فاقد ارزش است.
کارکنان سازمان در مدل‌های سازمانی نمایش داده ‌می‌شوند. این مدل‌ها برای تخصیص فعالیت‌ها به افراد ماهر و شایسته‌ و انجام آن فعالیت مورد استفاده قرار‌می‌گیرند. می‌توان برای پشتیبانی از فرآیندهای درون‌سازمانی کسب‌ و کار از سیستم‌های سنتی مدیریت گردش کاری استفاده كرد.
هنگام پرداختن به فرآیندهای متعامل کسب‌ و کار باید چندین مساله را مدنظر داشت. این مسائل علاوه‌ بر جنبه‌های ارتباطاتی مرتبط با ساختارهای فرآیندها شامل مسائل قانونی نیز هستند.

تراکنش‌ها بین فرآیندهای کسب‌ و کار باید به‌وسیله‌ قراردادهای لازم الاجرای قانونی بین سازمان‌های درگیر محافظت شود.
همچنین، لایه‌ فنی (مرکز تعالی کسب و کار؛ نقش مرکز هدایتگر در یک فرایند تعالی گرا دارد) در این گونه موارد نیازمند تعمق بیشتر است؛ زیرا در تراکنش بین چند سازمان، تفاوت زیرساخت‌های نرم‌افزاری ممکن است در همکاری نرم‌افزارها خلل ایجاد نماید.